Przewód pokarmowy człowieka zasiedlony jest przez tysiące gatunków bakterii, grzybów i wirusów. Jest to najgęstszy naturalny ekosystem bakteryjny z dotychczas poznanych. Udowodniono, iż mikroflora jelitowa odgrywa kluczową rolę w utrzymaniu zdrowia. Jej skład zależy od wielu czynników, takich jak wiek, dieta, region geograficzny czy stosowane leki.